... eines Hauses in einem Vergnügungsviertel. Nicht nur das dies ungewöhnlich ist, eine Woche später bekommen Mädchen aus ihrer Klasse E-Mails von der Verstorbenen. Einige halten die Mails für Fälschungen, andere glauben an ihre Echtheit.
Nur Lain bekommt davon kaum etwas mit. Das introvertierte Mädchen hat weder einen aktuellen Computer, noch weiß sie etwas vom WIRED, einem neuartigen Datennetzwerk oder sonstigen Dingen.
Dann entschließt sich Lain jedoch dazu, ihren NAVI einzuschalten und tatsächlich hat sie eine Mail von dem Mädchen, dass sich umgebracht hat. Die Mail sagt:
"Ich bin nicht gestorben, ich habe bloß meinen Körper aufgegeben."
Von da an wird Lain neugierig. Sie lässt sich ein topaktuelles Modell von ihrem Vater kaufen und versinkt immer mehr in einer Welt, die ihr sonst fremd war. Doch je mehr sie sich im WIRED aufhält, desto mehr vertliert Lain den Bezug zur Realität und zu ihren Freundinnen.
Was ist das WIRED eigentlich? Um wen handelt es sich bei der mysteriösen Gruppe die sich selbst KNIGHTS nennt? Und wer ist die "Lain aus dem WIRED"?
Fragen die Lain zu beantworten versucht...