... Weltkrieges kümmert sich der sogenannte "Magdalenaorden" um Geister und anderes Unheil das während des Wirtschaftswachstums in New York sein Unwesen treibt.
Erzählt wird die geschichte von Rosette Christopher, einer Nonne die auf die Dämonenvernichtung ausgebildet ist, und ihrem Partner Chrno, er ein Halbdämon ist und vertraglich an Rosette gebunden wurde, so dass sie die Kontrolle über seiner Kräfte hat. Beide bekommen den Auftrag den Dämonenmeister Ricardo zu stoppen, der zeitgleich einer der mächtigsten Männer des Landes ist.
Zeitgleich sucht Rosette nach ihrem verschollenen Bruder Joshua, der auch eine entscheidende Rolle in Chrnos Vergangenheit zu spielen scheint...