... Anderson (Keanu Reeves) an die Spitze der Branche geschafft. Allerdings wird er von Unsicherheiten und Unklarheiten verfolgt, es fällt ihm schwer Realität, Erinnerungen und Einbildung klar zu trennen und so ist er bei einem Psychoanalytiker (Neil Patrick Harris) in Behandlung, nimmt jede Menge Pillen. Dann ist da auch noch Tiffany (Carrie-Anne Moss), die Thomas immer mal wieder im Cafe trifft - sich aber nicht traut sie anzusprechen. Die Frau hat enorme Ähnlichkeiten mit der Trinity-Figur der Matrix-Spielewelt. Aber ist das alles nur Zufall? Thomas hat so seine Zweifel und beschließt, ein paar Schritte aus dem Alltagstrott zu wagen.