... taucht nun in der Stadt Tateyama ein neuer Godzilla auf. Die Armee ist machtlos und aufgrund einer Panikreaktion kommt es zu Toten. Die Soldatin Akane Yashiro übernimmt die Verantwortung für den Unglücksfall und wird ins Archiv strafversetzt. Währenddessen arbeiten die Wissenschaftler an einer Waffe, die Godzilla endgültig besiegen soll. Aus den Knochen des Ur-Godzilla wird der Mechagodzilla geschaffen. Hat die Menschheit mit Hilfe des Mechagodzilla eine Chance zu überleben?