... Ethan Burke (Matt Dillon) in der verschlafenen Kleinstadt Wayward Pines wieder. Mit einem Kollegen war er auf der Suche nach einem vermissten Agenten. Das Krankenhaus, in dem Burke zu sich kommt, erscheint ihm merkwürdig. Gegen den Rat der Schwester macht sich Ethan auf die Suche nach seinen persönlichen Sachen, die im Sheriff-Büro liegen sollen. Doch Gesetzeshüter Pope (Terrence Howard) kann ihm auch nicht weiterhelfen. Ohnehin hat Burke den Eindruck, dass in dem Ort einiges nicht zu stimmen scheint. Er bemerkt Abhöranlagen und Sicherheitskameras, zudem scheint nur Falschgeld im Umlauf zu sein. Burke will aus der Stadt raus, zurück nach Seattle zu seiner Frau und seinem Sohn. Doch die Akte "Wayward Pines" ist weit komplexer als zunächst gedacht.