... Forschungslabor ein neues Subatomares Teilchen entdeckt, auf dessen Basis eine neuartige Energiewaffe im Erd-Orbit gebaut wird. Doch beim ersten Test öffnet sich ein Portal zu einer anderen Dimension, durch das ein riesiger Körper aus unbekanntem Material auf die Erde gelangt.
Mit der Androhung von Gewalt werden die beiden U-Boot Piloten Takuya und Haruka dazu gezwungen eine Probe von diesem Körper zu beschaffen, was ihnen auch mit größter Mühe gelingt. Takyu verlässt daraufhin allerdings aus Protest die Basis, während sein Freund weiter forscht.
Drei Jahre später erreicht ihn allerdings plötzlich ein Brief von Haruka, der ihn dringend bittet zur Insel zurückzukommen und ihm zu helfen, ja ihn sogar bittet ihn zu töten. Sofort macht sich Takuya auf den Weg, doch zurück im Forschungslabor angekommen scheint alles normal zu sein und Haruka kann sich an keinen Brief erinnern. Doch dann ereignet sich plötzlich ein mysteriöser Zwischenfall bei dem mehrerer Militärjets verunglücken, worauf das die gesamte Anlage besetzt.